Gracias a SMB 3.0 disponible con Windows Server 2012, Hyper-V nos permite ahora el crear maquinas virtuales y sus correspondientes discos utilizando un servidor de ficheros para ubicar los mismos. La verdad es que ya era hora de poder realizar algo así.
Para ello solo debemos de tener un recurso compartido con permisos NTFS y de compartición para el usuario que crea la maquina y el host que la alberga, y luego poner la ruta UNC correcta donde vamos a ubicar el disco y el archivo de configuración. Con esto ya podremos ejecutar nuestra maquina virtual sobre un recurso compartido.